La recherche italienne investit dans la bioinformatique

Découvrir les anomalies présentes dans les molécules qui provoquent le cancer, grâce à un super ordinateur et à un robot permettant de réaliser dix fois plus d'expériences que les systèmes professionnels. Voilà les instruments de la plateforme de bio-informatique de l'Institut FIRC d'oncologie moléculaire (IFOM) de Milan.
C'est la deuxième année consécutive que l'institut a obtenu 350 000 euro de l'AIRC, l'Association Italienne pour la Recherche sur le Cancer qui a financé en tout, pour le premier semestre 2005, 27,32 M euros destinés à soutenir 386 projets de recherche. Le physicien allemand, Thomas Schneider, spécialisé en biologie moléculaire et structurelle, et coordinateur de la plateforme de bio-informatique depuis octobre 2003, sait clairement comment utiliser les fonds mis à leur disposition: "mon premier objectif est de "consolider" l'équipe de 31 chercheurs qui travaillent dans neuf établissements italiens", a-t-il déclaré. 50 000 euro ont déjà été investis pour l'achat d'un super ordinateur relié à 20 terminaux informatiques, qui pourraient arriver à 100 en l'espace d'un mois.
Mais cela ne suffit pas, la prochaine étape sera de rendre le logiciel plus accessible et utilisable, et surtout disponible sur Internet. Rappelons que le volume des informations produit chaque jour dans les laboratoires est gigantesque. Grâce au robot muni de "nanodispenser", les chercheurs peuvent effectuer en deux ou trois heures environ 2500-3000 expériences en analysant simultanément la structure de trois protéines.
L'IFOM a choisi un secteur de recherche très complexe : l'étude de la structure moléculaire des protéines présentes dans les tumeurs. L'objectif final est de trouver des médicaments qui attaquent les structures "pathologiques" des protéines, celles à partir desquelles se développe un cancer. C'est la raison pour laquelle nous devons avoir le plus d'informations possibles sur les molécules en question, et ceci grâce à une technique particulière appelée "cristallographie". Bref, en créant des cristaux de molécules et grâce aux millions d'informations élaborées, nous espérons arriver à définir et à différencier la structure protéique saine de la structure "malade".
Sources : Il Sole 24 Ore - 27/07/05
Rédacteur : David Boucard, david.boucard(a)diplomatie.gouv.fr
Sources : Ambassade de France Italie - Adit